1967 劉棠瑞、呂福原。臺灣山茶科根據葉部形態之分類。國立臺灣大學農學院實驗林研究報告 52號。1-55頁。
新組合 Adinandra milletii Benth. et Hook. f. ex Hance var. hypochlora (Hay.) F. Y. Lu et T. S. Liu 綠背楊桐
1969 呂福原。臺灣產楨楠屬(樟科)之訂正。中華林學季刊2(3): 12-36。
新種 Machilus mushaensis F. Y. Lu 霧社楨楠
1976 呂福原。台灣雙子葉植物新見(二)。中華林學季刊9(2): 127-143。
新種 Rubus arachnoideus Y. C. Liu et F. Y. Lu 灰葉懸鈎子
Rubus hopingensis Y. C. Liu et F. Y. Lu 和平懸鈎子
Rubus ilanensis Y. C. Liu et F. Y. Lu 宜蘭懸鈎子
Rubus urophyllus Y. C. Liu et F. Y. Lu 尾葉懸鈎子
Rubus yuliensis Y. C. Liu et F. Y. Lu 玉里懸鈎子
Aralia taiwaniana Y. C. Liu et F. Y. Lu 台灣土當歸
新變種 Rubus parviaraliifolius Hay. var. lzxiflorus Y. C. Liu et F. Y. Lu 小楤葉懸鈎子
Rubus pseudoacer Makino var. flexuosus Y. C. Liu et F. Y. Lu 清水懸鈎子
Stellaria monosperma D. Don var. taiwaniana Y. C. Liu et F. Y. Lu 瑞里繁縷
新記錄屬 Berrya Roxb. 六翅木屬
Lepistemon Bl. 鱗蕊藤屬
新紀錄種 Hypericum laxum Koidz. 小地耳草
1977 呂福原。台灣雙子葉植物新見(三)。中華林學季刊10(3): 85-102。
新種 Dumasia miaoliensis Y. C. Liu et F. Y. Lu 苗栗野豇豆
Hydrangea taiwaniana Y. C. Liu et F. Y. Lu 台灣大枝掛繡球
Symplocos shilanensis Y. C. Liu et F. Y. Lu希蘭灰木
新變種 Eurya leptophylla Hayata var. tsushanensis Y. C. Liu et F. Y. Lu 祝山柃木
新記錄種 Potentilla amurensis Maxim. 小花金梅
Ilex crenata Thunb. 犬黃楊
Physalis peruviana Linn. 祕魯苦蘵
確認爭議種 Sida javensis Cavan. 圓葉金午時花
Marsdenia tomentosa Moore et Decaisne 假防巳
Barbarea orthocera Ledeb. var. formosana Kitamura 山芥菜
Barbarea taiwaniana Ohwi 台灣山芥菜
1978 呂福原。台灣雙子葉植物新見(四)。中華林學季刊11(3): 95-114。
新種 Boehmeria hwalienensis Y. C. Liu et F. Y. Lu 花蓮苧麻
Boehmeria pilushanensis Y. C. Liu et F. Y. Lu 畢祿山苧麻
Berchemia arisanensis Y. C. Liu et F. Y. Lu 阿里山黃鱔藤
Ranunculus taiwanensis Y. C. Liu et F. Y. Lu 台灣毛茛
Stautonia purpurea Y. C. Liu et F. Y. Lu 紫花野木瓜
新記錄種 Dunbaria merrillii Elmer 麥氏野扁豆
Ixeris stolonifera A. Gray 蔓苦藚
確認爭議之分類群 Prurus phaeosticta Maxim. var. ilicifolia Yamamoto 冬青葉桃仁
Berchemia racemosa Sieb. et Zucc. var. magna Makino 大黃鱔藤
新分佈種 Microtropis japonica Hall. f. 日本賽衛矛
Akebia chingshuiensis Simizu 三葉木通
1979 呂福原。台灣雙子葉植物新見(五)。中華林學季刊12(4): 73-89。
新種Crotalaria chiayiana Y. C. Liu et F. Y. Lu 紫花野百合
Desmodium nantoensis Y. C. Liu et F. Y. Lu 南投山螞蝗
Rotala taiwaniana Y. C. Liu et F. Y. Lu 玉里水豬母乳
新變種 Cassia sophora L. var. penghuana Y. C. Liu et F. Y. Lu 澎湖決明
Crotalaria triquetra Dalzell var. garanbiensis Y. C. Liu et F. Y. Lu 鵝鑾鼻野百合
新記錄種 Cassia floribunda Ca. 繁花決明
Crotalaria bialata Schrank 翼莖野百合
確認未定種 Mimosa invisa Mart. ex Colla 美洲含羞草
Uraria aequilobata Hosokawa 圓葉貓尾草
Ammannia multiflora Roxb. 多花水莧菜
1987 Lu, Fu-Yuan and Chiou-Cheng Liao. A Taxonomic Study on the Podocarpaceae of Taiwan. J. National chiayi Institute of Agricalture 16: 61-76.
1988 劉業經、呂福原、歐辰雄、陳堃霖。台灣產桑寄生科植物分類之研究。中華林學季刊21(2): 3-24。
名制考證,確認台灣產桑寄生科植物有5屬15種
1990 劉業經、呂福原、歐辰雄、王秋美。臺灣產鼠李科植物分類之研究。國立中興大學農學
院實驗林研究報告12: 1-38。
1996 沈瑞琛、歐辰雄、呂福原。臺灣產十字花科植物分類之研究。國立中興大學實驗林研究
報告18(1): 1-44。
2003 鄧書麟、呂福原、何坤益。台灣產鬼針屬植物分類之研究。中華林學季刊36(4): 331-348。
新變種 Bidens pilosa L. var. trivalvis F. Y. Lu et S. L. Deng 裂瓣鬼針
2003 呂福原、許媖素。臺灣產大戟科之一新種-卵葉饅頭果。林業研究季刊25(4): 83-86。
新種 Glochidion ovalifolium F. Y. Lu et Y. S. Hsu卵葉饅頭果
2005 莊瑞均、曾喜育、呂福原、歐辰雄。臺灣榕屬植物果核形態之研究-綿毛榕、無花果榕與薜荔榕亞屬。中華林學季刊 38(1): 1-18。
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2005 鄧書麟、呂福原、何坤益、郭育妏。台灣鬼針屬Bidens pilosa種群遺傳變異之研究。中
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2005 Lu, Fu-Yuan, Kun-Cheng Chang, and Kwo-Shang Lai. Cotoneaster dammeri Schneid.
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新紀錄種 Cotoneaster dammeri Schneid. 矮生栒子
2006 黃美惠、呂福原、陳周宏、林德勳、鄧書麟、葉若鋆。臺灣產李亞科(薔薇科)植物木材解
剖系統分類。臺灣林業科學21(2): 215-231。
位階變更 Prunus transarisanensis Hayata var. takasagomontana (Sasaki) F. Y. Lu, M. H. Huang et T. H. Lin 白花山櫻
2006 許媖素、呂福原、鄧書麟、廖政麒。台灣產饅頭果屬植物(大戟科)之分類研究。林業研究季刊28(3): 49-68。
2006 Tzeng, Hsy-Yu, Fu-Yuan Lu, Chern-Hsiung Ou, King-Cherng Lu, and Li-Jung Tseng. Pollinational-mutualism Strategy of Ficus erecta var. beecheyana and Blastophaga nipponica in Seasonal Guandaushi Forest Ecosystem, Taiwan. Botanical Studies 47(3): 307-318.
2006 曾喜育、莊瑞均、歐辰雄、呂福原。臺灣榕屬植物果核形態之研究―澀葉榕與埃及無花果榕亞屬。臺灣林業科學 21(4): 461-472。
2007 何坤益、李武林、呂福原。利用ISSR分子標誌探討阿里山十大功勞族群遺傳多樣性。林業研究季刊 29(3): 27-40。
2008 Kuo, Yu-Wen, Fu-Yuan Lu, Ming-Horng Duh, and Shu-Lin Deng. A New Species, Alpinia
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新種 Alpinia nantoensis F. Y. Lu et Y. W. Kuo 南投月桃
2008 鄧書麟、呂福原、沈勇強、鄭正義、張坤城。台灣與鄰近島嶼水芫花族群遺傳多樣性之研究。中華林學季刊41(2): 149-164。
2009 Chang, Kun-Cheng, Kwo-Shang Lai, Fu-Yuan Lu, Chih-Chiang Wang. Corrections in Cotoneaster (Rosaceae) in Taiwan. Taiwan Journal of Forest Science. 24(1): 69-74.
新紀錄種 Cotoneaster bullatus Bois 泡葉栒子
專書、專論
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新變種 Vitis thunbergii Siebold et Zucc. var. taiwaniana F. Y. Lu 小葉葡萄
新組合 Ampelopsis brevipedunculata (Maxim.) Trautv. var. ciliate (Nakai) F. Y. Lu 毛山葡萄
Ampelopsis cantoniensis (Hook. et Arn.) Planch. var. leecoides (Maxim.) F. Y. Lu 大葉廣東山葡萄
Cissus lanyuensis (C. E. Chang) F. Y. Lu 蘭嶼粉藤
1977 Fu-Yuan Lu. Leeaceae. In H. L. Li et al. (eds.), Flora of Taiwan. 3: 681-683. Epoch Publ. Co. Taipei.
1978 Fu-Yuan Lu, and Muh-Tsuen Kao. Asclepiadaceae. In H. L. Li et al. (eds.), Flora of Taiwan. 4: 222-246. Epoch Publ. Co. Taipei.
1978 呂福原、廖秋成、歐辰雄。南洋材。紅豆出版社。
1988 劉業經、呂福原、歐辰雄。臺灣樹木誌。國立中興大學農學院。
1990 呂福原、蔡崑煌、莊純合、張義雄。臺灣商用木材圖鑑。行政院農業委員會。
1993 Yeh-Ching Liu, Fu-Yuen Lu, Chern-Hsiung Ou, and Chiou-Meei Wang. Rhamnaceae. In T. C. Huang et al. (eds.), Flora of Taiwan, 2nd ed. 3: 680-695. Editorial Committee of the Flora of
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Editorial Committee of the Flora of Taiwan, Second Edition, Taiwan, Taipei.
1993 Fu-Yuen Lu. Leeaceae. In T. C. Huang et al. (eds.), Flora of Taiwan, 2nd ed. 3: 711-713.
Editorial Committee of the Flora of Taiwan, Second Edition, Taiwan, Taipei.
1994 劉業經、呂福原、歐辰雄。臺灣樹木誌(增訂版)。國立中興大學農學院出版委員會。
位階變更Rhododendron ovatum Planch. var. lamprophyllum (Hayata) Y. C. Liu, F. Y. Lu et C. H. Ou 長卵葉馬銀花
1994 呂福原、歐辰雄、呂金誠。臺灣常見樹木解說手冊。臺灣省農林廳林務局。
1995 呂福原、歐辰雄。臺灣常見樹木解說手冊(續)。國立中興大學森林學系、臺灣省林務局
編印。
1996 Jen-Jye Peng, and Fu-Yuen Lu. Actinidiaceae. In T. C. Huang et al. (eds.), Flora of Taiwan, 2nd ed. 2: 656-661. Editorial Committee of the Flora of Taiwan, Second Edition, Taiwan.
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1997-2001 呂福原、歐辰雄、呂金誠。台灣樹木解說(一至五冊)。行政院農業委員會。
2000 呂福原、歐辰雄、陳運造、祁豫生、呂金誠。臺灣樹木圖誌第一卷。國立中興大學森林
植物分類生態研究室。
2006 呂福原、歐辰雄、陳運造、祁豫生、呂金誠、曾彥學。臺灣樹木圖誌第二卷。國立中興
大學森林植物分類生態研究室。
新組合 Salix morrisonicola Kimura var. takasagoalpina (Koidzumi) F. Y. Lu et al. 高山柳
Salix taiwanalpina Kimura var. chingshuishanensis (S. S. Ying) F. Y. Lu et al. 清水山柳
Sarcococca longipetiolata Cheng et Wu var. dioica (Hayata) F. Y. Lu et al. 柳葉野扇花
Styrax faberi Perk. var. formosanum (Matsum.) F. Y. Lu et al. 松村氏野茉莉
位階變更 Buxus microphylla S. et Z. var. sinica (Rehd. Et Wils.) form. tarokoensis (S. Y. Lu et Y. P. Yang) F. Y. Lu et al. 太魯閣黃楊
Celtis sinensis Persoon var. nervosa (Hemsl.) F. Y. Lu et al. 小葉朴
Celtis sinensis Persoon var. tetrandra (Roxb.) F. Y. Lu et al. 石朴